@Jovir
Izgleda da sam izuzetak (intel procesor, intel cipset)
Znači, to smo eliminisali...

Elem, ja sam to radio pre nekoliko godina kombinacijom mencodera i transcodea, doduše u mpeg2 format koji je pogodan za DVD strukturu. Problema sa asinhronizacijom nisam imao. Doduše, video player je preko scarta bio povezan na kompozitni video ulaz TV katre, a ne grafičke, a audio na kompozitni ulaz zasebne audio kartice.
E, sad...
Ne liči mi na softverski problem, mada možeš da probaš i transcode i mpeg2 format.
Ne verujem da je problem sa mplayerom-mencoderom, mada je preveliki video bitrate, sa VHS-a na bitrate 2000??? Previše, ništa ne dobijaš, jer isti kvalitet sa VHS-a postižeš i sa bitrate 800 - 1000 u mpeg4 formatu (ograničenje je kvalitet VHS snimka).
Moguće je da je problem i do codeca, instaliraj najnoviji ffmpeg i lame...
Hardverski uzrok problema je izvesniji. Verovatno dobijaš kašnjenje signala tokom obrade u grafičkoj ili zvučnoj kartici, ako smo eliminisali ne-Intel uzrok.
Ako imaš TV karticu probaj preko nje.
Jedno je sigurno... Čeka te mnogo proba i dosta izgubljenog vremena na rešavanju problema. Ja sam odavno digao ruke od ove konverzije, bude to jeftinije dati ljudima koji imaju opremu za prebacivanje VHS-a na DVD...
Pozdrav!